Sau khi Nobunobu lên cầm quyền, hắn bắt đầu thanh trừng vây cánh của Tướng Quân tiền nhiệm. Shinsengumi buộc phải giải tán, cục trưởng Kondo và bố già Matsudaira bị đem đi hành quyết. Trước tình hình đó, Kondo đã ủy thác cho Gintoki kêu gọi toàn cục khởi nghĩa!?