Bí ẩn về Tiến hóa Mega dần sáng tỏ… Trong khi đó, đội của X cũng đón thêm thành viên mới, sẵn sàng đối mặt với những trận chiến mỗi lúc một trở nên khốc liệt hơn. Mặt khác, tại trụ sở chính của những người thừa kế Tiến hóa Mega – tòa tháp chuyên gia – kẻ tấn công ẩn dưới bộ đồ co giãn chính là viên đạn đen Esprit!!!